水系统中央空调：通俗点讲就是中央空调系统是以水为冷媒介质，也就是人们常说的冷(热)水机组，室内负荷全部由冷热水机组来承担。各房间末端设备（通常是风机盘管）通过管道与冷热水机组相连，靠主机系统所提供的冷（热）水来向室内供冷（供热）。水系统布置灵活 ，独立调节性好，舒适度非常高，能满足复杂房型分散使用、各个房间独立运行的需要。水系统制冷制热速度相对于氟系统来说要慢，但是水系统在冬季制热受温度影响要比氟系统小。另水系统可以加壁挂炉辅助采暖，冬季采暖效果比较好。并且水系统主要适用于大面积的场所，并且由于水系统冷媒使用是水，水系统吹出的风温和不干燥，系统运行时也不会带走空气中的水份，非常舒适。 
氟系统中央空调：通俗点讲就是冷媒管中的冷媒介质为氟利昂，常见的形式有一拖多的多联机组和一拖一的风管机组。而其中最常见的应用最广的氟系统中央空调就是多联机，它可以同时调节多个房间的温度；另外，它的室外机组采用的是变频式的压缩机，可根据室内冷热负荷的变化来自动调节压缩机的工作状态，以满足室内冷热负荷的要求，控温精准又省电。氟系统制冷制热时速度很快，但是在冬季当温度低于—5℃以下时，由于存在主机系统化霜，所以制热效果较差。氟机采用变频技术，具有控制精度高，节能高效等特点。但是由于氟系统冷媒使用的是氟利昂，在机器运转时会带走室内空气中的水分，使得室内空气干燥，舒适性较差。